草莓根系是由不定根组成的须根系，须根只发生在短缩茎，无主侧根之分，主要分布在表层土壤中。一般健壮的植株可发生20～50条初生根，多的可发生100条以上。草莓的根系在土壤中分布很浅，一般分布在距地表20厘米深的表土层内。其新根为白色，随着根的老化，颜色由白色转为褐色，***后变黑枯死，初生根的寿命一般为一年左右。

草莓植株根系1年内有2～3次生长高峰，早春当气温上升到2～5℃或10厘米深的土层地温稳定在1～2℃时，根开始生长，此时主要是上一年秋季发出的白色越冬根进行生长，根系生长要比地上部分早生长10天左右，为******次生长高峰。7月上中旬正值高温和长日照，此时有利于草莓的营养生长，在草莓的腋芽处会萌发大量的匍匐茎，新茎基部也会发生许多新根系，这是根系生长的第二次高峰。9月下旬至越冬前，由于叶片养分回流运转及土壤温度降低，营养大量积累并贮藏于茎内，此次为根系的第三次生长高峰。